研究领域 生物组织高通量序列图像实时配准技术
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简历
教育经历
2000年- 2004年,西安交通大学,学士
2004年- 2009年,中国科学院自动化研究所,工学博士
工作经历:
2021-04~现在, 中国科学院自动化研究所, 研究员
2012-10~2021-04,中国科学院自动化研究所, 高级工程师
2009-07~2012-10,中国科学院自动化研究所, 助理研究员
学术成就
发表论文
1. Virus Identification in Electron Microscopy Images by Residual Mixed Attention Network, Computer Methods and Programs in Biomedicine, 2021, 第 2 作者
2. Human Attention-inspired Volume Reconstruction Method on Serial Section Electron Microscopy Images, Cytometry: Part A, 2021, 通讯作者
3. Dual Networks for High-Precision and High-Speed Registration of Brain Electron Microscopy Images, Brain Sciences, 2020, 通讯作者
4. SiamBOMB: A Real-time AI-based System for Home-cage Animal Tracking, Segmentation and Behavioral Analysis, IJCAI, 2020, 第 1 作者
5. A common hub for sleep and motor control in the substantia nigra, Science, 2020, 第 8 作者
6. Robust Global Optimized Affine Registration Method for Microscopic Images of Biological Tissue, International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing(ICASSP), 2020, 通讯作者
7. Skeleton-based image registration of serial electron microscopy sections, SPIE Medical Imaging, 2019, 第 1 作者
8. Image deformation based on contour using moving integral least squares, IET Image Processing, 2019, 通讯作者
9. Fully Deep Convolutional Neural Networks for Mitochondria Segmentation, SPIE Medical Imaging, 2018, 第 3 作者
10. An unsupervised network for fast microscopic image registration, SPIE Medical Imaging, 2018, 通讯作者
11. Correlative light and electron microscopy for complex cellular structures on PDMS substrates with coded micro-patterns, Lab on a Chip, 2018, 通讯作者
12. Non-iterative simulations rigid registration method for serial sections of biological tissue, IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, 2018, 通讯作者
13. Morphology-Retained Non-Linear Image Registration of Serial Electron Microscopy Sections, IEEE International Conference on Image Processing, 2018, 第 1 作者
14. Deep Contextual Residual Network for Electron Microscopy Image Segmentation in Connectomics, IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, 2018, 第 3 作者
15. A Refined Spatial Transformer Network, International Conference on Neural Information Processing, 2018, 通讯作者
专利成果
1. 一种对扫描电子显微镜图像畸变进行校正的方法, 发明, 2015, 第 1 作者, 专利号: ZL201110014855.6
2. 多幅显微图像拼接中的灰度校正方法及装置, 发明, 2018, 第 1 作者, 专利号: 201711287182.5
3. 生物组织序列切片显微图像的配准方法及装置, 发明, 2020, 第 1 作者, 专利号: 201710638426.3
4. 面向序列切片的扫描电镜图像实时配准装置及方法, 发明, 2020, 第 1 作者, 专利号: 201711248908.4
5. 显微序列图像拼接方法及装置, 发明, 2019, 第 1 作者, 专利号: 201811213303.6
6. 生物样品三维结构的构建方法及装置, 发明, 2021, 第 1 作者, 专利号: 201811213305.5
7. 大视场光学显微图像成像装置及方法, 发明, 2020, 第 1 作者, 专利号: 201811213274.3
8. 基于X光图像的生物组织电镜图像校正方法、系统和装置, 发明, 2021, 第 1 作者, 专利号: 202011372160.0
在研课题
1. 序列切片透射电镜电子断层成像数据配准系统研制, 主持, 部委级, 2020-09--2022-08
2. 笼养动物实时跟踪、分割和行为分析的智能化系统, 主持, 部委级, 2020-01--2024-12
3. 中科院关键技术人才, 主持, 部委级, 2019-01--2021-12